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私達の研究室では、「視細胞における光情報変換」や「薄明視・昼間視・色覚」の分子メカニズムを明らかにするため、光受容体を中心にして種々のタンパク質の分子的な性質を原子・アミノ酸のレベルから研究しています。基本的な研究スタンスは、生物物理学、生化学、分子生物学であり、生理機能に結びつくタンパク質分子の性質（タンパク質分子の生理学的性質）とはどのようなものかに興味を持って研究を続けています。
また、光受容体がGPCRの中で最も研究が進んでいる「トップランナー」であることから、光受容体をモデルとしてGPCR一般の構造・機能相関や分子設計を解析する取り組みを始めています。
さらに、光受容体・GPCRファミリーをターゲットとして、先祖型タンパク質の基本構造がどのように変化して現在の多様な機能が獲得されたのかを明らかにするため、機能の多様化を生み出す重要なアミノ酸残基を発見・同定することをめざしています。
筑波大学の谷口准教授、千葉大学の露崎特任講師との共同研究に関するプレスリリースが発表されました。
BioJapan2025の京大サテライトイベントKYOTO DAY＆KYOTO INNOVATION CONNECT 2025（東京）で山下講師が講演を行いました。
日本生物物理学会（奈良）で山下講師と酒井博士ががポスター発表を行いました。
日本動物学会（名古屋）で山下講師がポスター発表を行いました。
光生物学協会年会（滋賀）で今元准教授が口頭発表を行いました。
京都市主催の「大学発研究開発型スタートアップ創出促進事業」の講演会で、山下講師が講演を行いました。
京都市主催の「大学発研究開発型スタートアップ創出促進事業」の講演会で、山下講師が講演を行いました。
東京大学の神田准教授との共同研究に関するプレスリリースが発表されました。
山下講師の産学連携研究が、京都大学「医学領域」産学連携推進機構のwebサイトで紹介されました
第20回レチナール蛋白質国際会議(スイス)で山下講師が招待講演、酒井博士がポスター発表を行いました。