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今元研セミナー:論文紹介

今元研のセミナーで論文紹介されたもののリストアップです。

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2018

  

霊長類における桿体由来のシグナル伝達経路による適応について

Range, routing and kinetics of rod signaling in primate retina.
Grimes WN, Baudin J, Azevedo AW, Rieke F.
Elife2018 Oct 9;7. pii: e38281. doi: 10.7554

  

反転させたチャネルロドプシンの性質について

Expanding the Optogenetics Toolkit by Topological Inversion of Rhodopsins.
Brown J, Behnam R, Coddington L, Tervo DGR, Martin K, Proskurin M, Kuleshova E, Park J, Phillips J, Bergs ACF, Gottschalk A, Dudman JT, Karpova AY.
Cell2018 Nov 1;175(4):1131-1140.e11. doi: 10.1016

  

ショウジョウバエ概日中枢におけるパラレルな光情報伝達経路モデルについて

Hub-organized parallel circuits of central circadian pacemaker neurons for visual photoentrainment in Drosophila.
Li MT, Cao LH, Xiao N, Tang M, Deng B, Yang T, Yoshii T, Luo DG.
Nat Commun2018 Oct 12;9(1):4247. doi: 10.1038

  

IpRGCにおけるメラノプシン情報伝達経路の違いについて

Cyclic-Nucleotide- and HCN-Channel-Mediated Phototransduction in Intrinsically Photosensitive Retinal Ganglion Cells.
Jiang Z, Yue WWS, Chen L, Sheng Y, Yau KW.
Cell2018 Oct 18;175(3):652-664.e12. doi: 10.1016

  

ヒト網膜オルガノイドを用いた錐体サブタイプ発生の検証について

Thyroid hormone signaling specifies cone subtypes in human retinal organoids.
Eldred KC, Hadyniak SE, Hussey KA, Brenerman B, Zhang PW, Chamling X, Sluch VM, Welsbie DS, Hattar S, Taylor J, Wahlin K, Zack DJ, Johnston RJ Jr.
Science2018 Oct 12;362(6411). pii: eaau6348. doi: 10.1126/science.aau6348.

  

アニオンチャネルロドプシン GtACR1の結晶構造について

Crystal structure of the natural anion-conducting channelrhodopsin GtACR1.
Kim YS, Kato HE, Yamashita K, Ito S, Inoue K, Ramakrishnan C, Fenno LE, Evans KE, Paggi JM, Dror RO, Kandori H, Kobilka BK, Deisseroth K.
Nature2018 Sep;561(7723):343-348. doi: 10.1038/s41586-018-0511-6.

  

アニオンチャネルロドプシンの開閉メカニズムと機能について

Structural mechanisms of selectivity and gating in anion channelrhodopsins.
Kato HE, Kim YS, Paggi JM, Evans KE, Allen WE, Richardson C, Inoue K, Ito S, Ramakrishnan C, Fenno LE, Yamashita K, Hilger D, Lee SY, Berndt A, Shen K, Kandori H, Dror RO, Kobilka BK, Deisseroth K.
Nature2018 Sep;561(7723):349-354. doi: 10.1038/s41586-018-0504-5.

  

ゼブラフィッシュにおける視覚世界と視覚システムの相関について

Zebrafish Differentially Process Color across Visual Space to Match Natural Scenes.
Zimmermann MJY, Nevala NE, Yoshimatsu T, Osorio D, Nilsson DE, Berens P, Baden T.
Current Biology2018 Jul 9;28(13):2018-2032.e5. doi: 10.1016/j.cub.2018.04.075.

  

ヒト青錐体視物質の二次レチナールの取り込みについて

Human Blue Cone Opsin Regeneration Involves Secondary Retinal Binding with Analog Specificity.
Srinivasan S, Fernandez-Sampedro MA, Morillo M, Ramon E, Jimenez-Roses M, Cordomi A, Garriga P.
Biophysical Journal2018 Mar 27;114(6):1285-1294. doi: 10.1016/j.bpj.2018.01.032.

  

ナトリウムポンプ型ロドプシンの特性について

Identification of the key determinant of the transport promiscuity in Na+-translocating rhodopsins.
Mamedov AM, Bertsova YV, Anashkin VA, Mamedov MD, Baykov AA, Bogachev AV.
Biochem Biophys Res Commun.2018 May 15;499(3):600-604. doi: 10.1016/j.bbrc.2018.03.196.

  

Giタンパク質と結合するロドプシンのクライオ電子顕微鏡による構造解析について

Cryo-EM structure of human rhodopsin bound to an inhibitory G protein.
Kang Y, Kuybeda O, de Waal PW, Mukherjee S, Van Eps N, Dutka P, Zhou XE, Bartesaghi A, Erramilli S, Morizumi T, Gu X, Yin Y, Liu P, Jiang Y, Meng X, Zhao G, Melcher K, Ernst OP, Kossiakoff AA, Subramaniam S, Xu HE.
Nature.2018 Jun;558(7711):553-558. doi: 10.1038/s41586-018-0215-y.

光感受性神経節細胞のM5細胞が関与する反対色応答について

The M5 Cell: A Color-Opponent Intrinsically Photosensitive Retinal Ganglion Cell.
Stabio ME, Sabbah S, Quattrochi LE, Ilardi MC, Fogerson PM, Leyrer ML, Kim MT, Kim I, Schiel M, Renna JM, Briggman KL, Berson DM.
Neuron.2018 Jan 3;97(1):150-163.e4. doi: 10.1016/j.neuron.2017.11.030.

網膜損傷の治療に役立つと考えられる新規分子シャペロン・YC-001について

A novel small molecule chaperone of rod opsin and its potential therapy for retinal degeneration.
Chen Y, Chen Y, Jastrzebska B, Golczak M, Gulati S, Tang H, Seibel W, Li X, Jin H, Han Y, Gao S, Zhang J, Liu X, Heidari-Torkabadi H, Stewart PL, Harte WE, Tochtrop GP, Palczewski K.
Nat Commun. 2018 May 17;9(1):1976. doi: 10.1038/s41467-018-04261-1.

クラゲ生殖巣に発現するオプシンが関与する光に誘導される生殖制御について

A gonad-expressed opsin mediates light-induced spawning in the jellyfish Clytia.
Quiroga Artigas G, Lapebie P, Leclere L, Takeda N, Deguchi R, Jekely G, Momose T, Houliston E.
Elife. 2018 Jan 5;7. pii: e29555. doi: 10.7554/eLife.29555.

視細胞と双極細胞間のシナプスに存在するタンパク質 LRIT1の光順応への関与について

LRIT1 Modulates Adaptive Changes in Synaptic Communication of Cone Photoreceptors.
Sarria I, Cao Y, Wang Y, Ingram NT, Orlandi C, Kamasawa N, Kolesnikov AV, Pahlberg J, Kefalov VJ, Sampath AP, Martemyanov KA.
Cell Rep.2018 Mar 27;22(13):3562-3573. doi: 10.1016/j.celrep.2018.03.008.

RhoPDEの活性化メカニズムについて

A unique choanoflagellate enzyme rhodopsin exhibits light-dependent cyclic nucleotide phosphodiesterase activity.
Yoshida K, Tsunoda SP, Brown LS, Kandori H.
J Biol Chem. 2017 May 5;292(18):7531-7541. doi: 10.1074/jbc.M117.775569.

RhoPDEの光遺伝学ツールとしてのポテンシャルについて

Purification and Characterization of RhoPDE, a Retinylidene/Phosphodiesterase Fusion Protein and Potential Optogenetic Tool from the Choanoflagellate Salpingoeca rosetta.
Lamarche LB, Kumar RP, Trieu MM, Devine EL, Cohen-Abeles LE, Theobald DL, Oprian DD.
Biochemistry.2017 Oct 31;56(43):5812-5822. doi: 10.1021/acs.biochem.7b00519. Epub 2017 Oct 18.

ヘテロ多量体を形成するGPCRとアデニル酸シクラーゼの相互作用モデルについて

Evidence for functional pre-coupled complexes of receptor heteromers and adenylyl cyclase.
Navarro G, Cordomi A, Casado-Anguera V, Moreno E, Cai NS, Cortes A, Canela EI, Dessauer CW, Casado V, Pardo L, Lluis C, Ferre S.
Nat Commun. 2018 Mar 28;9(1):1242. doi: 10.1038/s41467-018-03522-3.

ロドプシンが関与する、ショウジョウバエ幼虫の忌避行動のメカニズムについて

Dedicated photoreceptor pathways in Drosophila larvae mediate navigation by processing either spatial or temporal cues.
Humberg TH, Bruegger P, Afonso B, Zlatic M, Truman JW, Gershow M, Samuel A, Sprecher SG.
Nat Commun. 2018 Mar 28;9(1):1260. doi: 10.1038/s41467-018-03520-5.

ショウジョウバエ幼虫の弦音器官の刺激受容細胞におけるロドプシンの機能について

Proprioceptive Opsin Functions in Drosophila Larval Locomotion.
Zanini D, Giraldo D, Warren B, Katana R, Andres M, Reddy S, Pauls S, Schwedhelm-Domeyer N, Geurten BRH, Gopfert MC.
Neuron.2018 Apr 4;98(1):67-74.e4. doi: 10.1016/j.neuron.2018.02.028.

レチナールにおける振動の位相による同位体効果について

Evidence for a vibrational phase-dependent isotope effect on the photochemistry of vision.
Schnedermann C, Yang X, Liebel M, Spillane KM, Lugtenburg J, Fernandez I, Valentini A, Schapiro I, Olivucci M, Kukura P, Mathies RA.
Nat Chem. 2018 Apr;10(4):449-455. doi: 10.1038/s41557-018-0014-y.